数据依赖采集（DDA）与数据非依赖采集（DIA）质谱技术是现代蛋白质组学研究中两种分析方法。数据依赖采集（DDA）与数据非依赖采集（DIA）质谱技术在蛋白质组学研究中各具特色，互为补充。DDA作为一种传统的质谱数据采集策略，被广泛应用于蛋白质鉴定和定量研究中。此外，DDA也被用来解析蛋白-蛋白相互作用网络，对于揭示蛋白质在细胞中的功能和相互作用机制至关重要。在生物标志物发现领域，DDA通过高精度的定量分析帮助研究人员鉴定潜在的疾病标志物，从而推动疾病的诊断和治疗方法的开发。例如，在癌症研究中，DDA帮助识别与肿瘤发生相关的蛋白质或代谢物标志物，提高早期诊断的准确性。与此相对，数据非依赖采集（DIA）是一种新兴的全扫描质谱数据采集策略。DIA的应用场景极为广泛，在生物制药领域，DIA通过高通量、全面的蛋白质组分析，帮助研究人员进行药物靶标的鉴定和药物作用机制的解析。这对于新药开发、药物筛选以及提高药物的靶向性和有效性具有意义。此外，DIA还可以用于监测药物在体内的代谢途径和药代动力学特征，帮助优化药物剂量和给药方案。

一、技术流程

1、DDA的技术流程

DDA技术的流程主要包括样品的制备、质谱分析、数据采集与处理。在样品制备阶段，蛋白质样品通常需要经过酶解等步骤以生成适合质谱分析的肽段。接下来，质谱仪对样品进行初步的m/z扫描，并选择达到一定强度的离子进行详细的碎片化分析。再通过质谱软件对采集的数据进行处理和分析，鉴定出目标蛋白。

2、DIA的技术流程

DIA技术的流程略有不同。样品准备阶段与DDA类似，但在质谱分析阶段，DIA对样品中的所有离子进行同步捕获和碎片化。通过这种方法，DIA生成了全面的质谱数据，能够在后续的数据处理阶段提供更为全面的分析结果。

二、优势与挑战

1、DDA的优势与挑战

DDA的主要优势在于其能够提供高特异性和高分辨率的质谱数据，适用于目标蛋白的鉴定和定量。然而，由于其依赖于预先选择的离子，DDA在分析复杂样本时可能会遗漏低丰度蛋白或生物信息。此外，DDA的分析速度相对较慢，限制了其在大规模蛋白质组学研究中的应用。

2、DIA的优势与挑战

DIA的优势在于其全面的数据覆盖和高灵敏度，使其特别适合于复杂样本的全面分析和比较研究。然而，DIA也面临着数据复杂性增加、数据处理难度提高等挑战，需要高效的数据分析软件和算法支持。

百泰派克生物科技拥有丰富的经验和专业的技术团队，能够根据客户的需求量身定制最优的质谱分析方案，助力科学家们在蛋白质组学研究中取得更大的突破。欢迎与我们合作，共同探索生命科学的奥秘。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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